9 сентября 2013 г на Новосибирской ГЭС были возобновлены холостые сбросы, для поддержания судоходных уровней ниже по течению Оби.
Пролет №2 водосливной плотины открыт на 1 м, при этом холостые сбросы составляют 159 м3/с. Общий среднесуточный расход - 2404 м³/с.
За счет емкости Новосибирского водохранилища гидростанция имеет возможность обеспечивать гарантированный расход воды, поддерживая необходимые уровни в нижнем бьефе.
Это имеет большое значение для перевозки груза в низовья Оби, где расположены нефтеносные районы, такие как Сургут и Тюмень.
Создание Новосибирского водохранилища позволило увеличить тоннаж новосибирского речного флота в 2,5 раза и продлить навигацию с 3-х до 5-ти месяцев.
Новосибирское водохранилище имеет площадь 1090 км2, полный объем - 8,8 км3.
Оно обеспечивает их комплексное многоцелевое использование водных ресурсов Оби.
Режимы работы Новосибирской ГЭС определяются в соответствии с текущей гидрологической обстановкой с учетом требований всех основных водопользователей.
При этом обеспечиваются потребности питьевого и хозяйственно-бытового водоснабжения, водного транспорта, городского, сельского и рыбного хозяйств, энергетики и др.
Плотина Новосибирской ГЭС играет исключительно положительную роль «в сдерживании воды» в Новосибирской области, позволяя сдерживать до 20 процентов паводка.
Помимо этого гидростанция обеспечивает надёжное энергоснабжение потребителей Новосибирской области, составляя 5-ю часть от всей выработки электроэнергии Новосибирской области.
Согласно ПИВР максимальный расход воды через гидроузел может составлять 21 900 м³/с (суммарно через гидроагрегаты, водосливную часть плотины и донные водоводы).