Зейская ГЭС работает в условиях продолжающегося летнего дождевого паводка, аккумулируя весь объем поступающей воды в водохранилище.
Имеющаяся резервная емкость сможет принять 25,3 км3 паводковых вод.
В соответствии со складывающейся гидрологической и водохозяйственной обстановкой на водных объектах, основываясь на прогнозе притоков, Амурским бассейновым водным управлением (АБВУ) установлен режим работы Зейского гидроузла через агрегаты с 1 августа текущего года в объеме 700±100 м3/с.
По состоянию на 1 августа 2014 г уровень Зейского водохранилища 312,23 м - это на 5 м ниже уровня наполнения прошлого года в данном периоде.
Суммарный приток воды к створу Зейской ГЭС за прошедшие сутки равен 3800 м3/с.
В 2013 г суммарный приток за аналогичный период составлял - 10500 м3/с, что в 2,7 раз меньше.
По данным Росгидромета приток воды в Зейское водохранилище в августе 2014 г ожидается в диапазоне 1700-2100 м3/с, при норме - 1780 м3/с.
Гидроэлектростанция работает в штатном режиме. Холостые сбросы не производятся. В период пропуска половодья осуществляется информационный обмен и взаимодействие органов власти, МЧС, руководства АБВУ, Амурского гидрометцентра, Управления эксплуатации Зейского водохранилища.
В 2013 г, в связи с продолжающимся ростом притока и достижением Зейским водохранилищем отметки - 317,5 м, в соответствие с Правилами использования водных ресурсов Зейского водохранилища на р. Зея, АБВУ установлен режим работы гидроузла суммарным средним расходом до 3500 м³/с, через водосливную часть плотины и гидроагрегаты.
Во время пропуска аномального паводка 2013 г Зейская ГЭС удержала около двух третей объема воды поступившего в водохранилище, существенно снизив масштабное затопление территорий Дальнего Востока.
Эксплуатация сооружений и оборудования дальневосточных ГЭС РусГидро осуществляется с неукоснительным соблюдением всех технических регламентов, правил и стандартов безопасности. Специалисты станций осуществляют полный комплекс необходимых мероприятий по контролю уровней притока и обеспечению нормального функционирования гидротехнических сооружений станций.
Каждый шаг гидроэнергетиков в эксплуатации станций очень жестко регулируется и контролируется государством: режимы наполнения и сработки водохранилищ, пропуск паводков на ГЭС устанавливает Министерство природных ресурсов в лице Федерального агентства водных ресурсов (Росводресурсы). У этого ведомства в регионах РФ существуют территориальные подразделения - БВУ (бассейновые водные управления), которые и определяют работу каждой расположенной в данном регионе гидроэлектростанции. Территориальные БВУ согласуют свои предложения по режиму работы ГЭС с территориальными органами МЧС РФ, Минсельхоза, Россельхознадзора, Росморречфлота, Росстроя, ОАО «Системный оператор Единой энергетической системы» с учетом интересов всех водопользователей и задач, стоящих перед этими ведомствами. Режимы работы ГЭС изменяются только после получения указаний БВУ.