Родился 7 февраля 1953 года в Москве.
В 1979 г. окончил Московский государственный институт международных отношений (МГИМО).
В 1979 г., после окончания Московского государственного института международных отношений (МГИМО), Алексей Подберезкин был зачислен в штат института на должность научного сотрудника.
В 1982 г. защитил кандидатскую диссертацию. Работал в Комитете молодежных организаций СССР , затем в Институте мировой экономики и Дипломатической академии МИД СССР.
В 1990 г. защитил диссертацию на соискание ученой степени доктора исторических наук.
В 1989 г. выступил одним авторов идеи перевода гуманитарной науки в режим самофинансирования.
В апреле 1990 г. Подберезкин возглавил Российско-Американский Университет (РАУ). Позднее (1992 г.), когда Университет был преобразован в РАУ - Корпорацию, Подберезкин стал президентом созданной научно-исследовательской и образовательной организации.
В 1991 - 1993 гг. внештатный советник вице-президента РФ Александра Руцкого.
В 1994 г. Подберезкин стал учредителем фонда "Духовное наследие", на основе которого в том же году было создано одноименное общественно-политическое движение.
На учредительном съезде, состоявшемся в мае 1995 г., он был избран председателем Центрального совета движения.
С 1994 г. активно сотрудничает с лидером КПРФ Геннадием Зюгановым. На президентских выборах 1996 г. был его доверенным лицом.
В 1996 г. был избран сопредседателем общественного движения "Народно-патриотический союз России".
В 1995 - 1999 г. - депутат Государственной Думы ФС РФ второго созыва. Занимал пост председателя комитета ГД по международным делам.
В декабре 1999 года на выборах депутатов Госдумы третьего созыва возглавлял избирательное объединение "Духовное наследие", не преодолевшее пятипроцентный барьер и не вошедшее в ГД. Одновременно баллотировался в Думу в Центральном избирательном округе №202 (г. Москва), получил 4,59% голосов. Победу в этом округе одержал Николай Гончар.
В марте 2000 года баллотировался на пост Президента Российской Федерации.
С 2000 г. по ноябрь 2004 г. - первый заместитель директора, Научно-исследовательский институт системного анализа Счетной палаты.
С 2004 г. по н/вр. - руководитель Федеральной Партии Социальной Справедливости; научный руководитель, Институт гражданского общества; научный руководитель, Агентство «Наследие»; член Совета при Президенте Российской Федерации по содействию развитию институтов гражданского общества и правам человека; профессор МГИМО МИД РФ.
Автор более 300 работ по вопросам экономики внешней и внутренней политики военного строительства в России. В работах 1997-1998 гг. "Русский путь" и "Русский путь: сделай шаг" им разработана концепция преодоления системного кризиса в России, духовного возрождения общества и становления России как ведущей мировой державы.
С декабря 2005 г. - лидер Партии Социальной Справедливости (ПСС), с апреля 2006 г. приостановил членство в партии в связи с назначением на государственную службу.
Преподает в ряде институтов, в т.ч. МГИМО МИД РФ.
Женат. Имеет троих детей. Владеет английским языком.