Основной целью деятельности ЧУ «Газпром ЦНИС» является разработка прогрессивных форм организации труда во всех видах деятельности, направленная на рациональное использование численности, проведение единой политики в области организации, нормирования и оплаты труда работников, развития систем профессиональных квалификаций и профессиональных стандартов нефтегазовой отрасли, взаимодействие с органами государственной власти различного уровня, общественными организациями, социальными партнерами, предприятиями нефтегазового комплекса и ведущими образовательными организациями. С 2016 года ЧУ «Газпром ЦНИС» будет исполнять полномочия Совета по профессиональным квалификациям в нефтегазовом комплексе России.